彼が倦怠期かもしれないです(19歳・女性）

彼氏さんのお言葉、とてもショックだったのではないでしょうか。
お付き合いされて３か月ほどとのことでしたので、お互いにお付き合いする前にはわからなかったことや知らなかったことに気づいてきた頃かと思います。
彼氏さんはお忙しい方とのことでしたので、おっしゃるとおり今はご自身のことに集中したいと考えているのかもしれません。一方で、お付き合いする前に描いていた理想やイメージと違ったなど、そういった気持ちが積み重なって、少し気持ちを整理したいと思っているのかもしれません。

連絡を取り合えていらっしゃるとのことでしたので、一旦彼氏さんのペースで過ごしてみてはいかがでしょうか。
無理に会う頻度や連絡頻度を増やそうとすると、彼氏さんが負担に思ってしまう可能性があるので、「忙しいなら無理しなくて大丈夫、応援してるよ」とお伝えしたうえで、少し先の予定を立ててみてはいかがでしょうか。先の約束があれば、ご相談者様も不安にならず過ごすことができると思います。

あまりお相手様のペースに合わせすぎるとご相談者様が不安になってしまうことがあると思いますので、あくまでご相談者様が落ち着ける範囲で少しお相手様のペースに合わせてみるのがよろしいかと思います。
何か参考になりましたら幸いです。

付き合い方について、彼と少し話し合ってみてはいかがでしょうか？
今はお互い大学生でしょうか。学校や学部、部活、バイトによってお互い忙しさは違いますし、学生の恋愛はプレゼントを用意するのも場合によっては一苦労ですから、ある程度は大目に見てあげましょう。
私も大学生の頃遠距離恋愛をしていたので、彼の気持ちもよく分かります。遠距離は続けば続くほど、心が離れる瞬間が来るものです。その時、付き合い方に負担があると、どうしても過剰に疲れてしまうのです。彼もそうではないでしょうか？
次会った時に、現在の付き合い方に負担がないか確認してみてください。例えば、プレゼントは誕生日だけにするとか、LINEは報連相をやめて週に一回日常会話を楽しむだけにするとか、彼の負担のない付き合い方を聞いてみてください。
また、あんまり好きじゃなくなった理由も、問い詰めるのではなく「嫌なことしてたなら申し訳ない」という程度でやんわり聞いてみてください。
まだまだ修復可能だと思いますよ。頑張ってください！