これは、どちらが嬉しいですか？(27歳・男性）

悩みますよね。どちらも気持ちは伝わりますが、より「特別」に感じるのは手渡し＋一言メッセージの方です。直接会って渡すと相手の反応も見られ、名入れの品がより心に残ります。まず最初の道しるべ：短時間で会える口実（お茶や軽い用事）を作って、手渡しで「いつもありがとう」など短い手書きの一言を添えて渡してみてください。

素敵なプレゼントですね。

LINEだと次回会った時にお相手の女性からあなたに対して直接お礼を伝えなければならないので、できればあなたから直接渡す方が女性への負担は少ないかもしれませんね。
それに、直接の方が「自分のために時間を割いてくれた」という部分も含めて私だったら嬉しく思います。

照れくさいかもしれませんが、もしあなたがお相手に好意を抱いているならアピールできるチャンスでもあります。
LINEでは重くなりすぎず気軽に渡せる感じでそれも場合によっては良い手段だと思いますが、少しでも関係を進展させるのであればぜひ直接渡してあげてください。
応援しています。