脈ありだと思っていた人に「勘違いしますよ」と言ったら「ごめん」と言われた。なんて返すのがベスト？(18歳・男性）

この状況で最も大切なことは、相手の感情を尊重しながら、同時に自分の気持ちも正直に伝えることです。ここでのキーは軽やかさと真摯さを兼ね備えた返信となります。

まず、彼女の「ごめん笑」の返信に対する反応として、自分が傷ついたり、驚いたりしていないことを伝えるためにも、ユーモアを交えることが大切です。「いやいや、大丈夫ですよ！冗談めかしてしまってすみません！」のように、明るく受け止める姿勢を示しましょう。これにより、相手も安心し、あなたへの信頼感を深めることができます。

しかし、このタイミングで、あなたがその人に関心があること、そして彼女とのつながりを大切に思っていることを、さりげなく、しかしはっきりと伝えることも重要です。たとえば、「でも正直に言うと、君との会話はいつも楽しくて、もっと君のことを知りたいなって思ってるんだ。誤解されたくないけど、これからも友達として、いい関係を続けていけたら嬉しいです！」のようなメッセージが良いでしょう。ここで、「友達として」という言葉を使用することで、相手にプレッシャーをかけずに、あなたの関心をさりげなく伝えることができます。

このような返信は、自分の感情を正直に伝えつつ、相手の気持ちを尊重するバランスが絶妙です。また、相手がどの程度関係を進展させたいかの仕草や返信から探る機会も与えられます。重要なのは心からのコミュニケーションで、相手の返信に期待せず、自分の気持ちと相手への尊敬を伝える態度を大切にすることです。

一意見になりますが回答せていただいます。
話の流れにもよると思いますが、「ごめん笑」でこの話題が終わってしまうとお相手様もどうしたらいいかわからないと思うので、少しだけつっこんだ質問をされてみてはどうでしょうか。
例えば「やっぱり勘違いしないほうがいいんですかね？」や「勘違いしてしまったら迷惑ですか？」など、相手の気持ちも少しだけ突っ込んで聞けるとおもうので、脈ありかどうかを確かめるられるかもしれません。
疑問形で聞いておけば、お相手様も返答がしやすいと思いますし、もし脈がなかったとしても「勘違いしないでください」と返答もしやすいと思います。「ごめんってどういうこと？」などと話を広げてしまうと、お相手様に不都合があった時に決まづくなってしまうと思うので、あえて質問で返すことで、お相手様の返答もしやすくなるのでよいかと思います。
何か参考になりましたら幸いです。